Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFCAB2Q5VUJ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EFCAB2Q5VUJ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms