Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms