Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms