Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT6Q5T7P8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms