Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIVEP3Q5T1R4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms