Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC178Q5BJE1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms