Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms