Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms