Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms