Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER3Q2NL68 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER3Q2NL68 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms