Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf58Q2M2W7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf58Q2M2W7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms