Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms