Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B3Q16720 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B3Q16720 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms