Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDK4Q16654 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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