Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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FXNQ16595 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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FXNQ16595 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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FXNQ16595 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FXNQ16595 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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