Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms