Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1EQ15878 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1EQ15878 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms