Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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