Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPTX1Q15818 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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