Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITSN1Q15811 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITSN1Q15811 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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