Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMGN3Q15651 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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