Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
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