Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX1-1Q15270 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX1-1Q15270 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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