Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN1Q15223 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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