Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNIP1Q15025 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNIP1Q15025 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms