Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAPTM4AQ15012 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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