Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms