Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTB1Q13884 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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