Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXOSC2Q13868 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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