Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
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SHROOM2Q13796 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
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SHROOM2Q13796 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
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SHROOM2Q13796 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHROOM2Q13796 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
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