Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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TUBA3CQ13748 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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