Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms