Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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