Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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