Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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MKRN4PQ13434 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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MKRN4PQ13434 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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MKRN4PQ13434 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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MKRN4PQ13434 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN4PQ13434 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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