Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRSQ13332 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRSQ13332 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRSQ13332 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PTPRSQ13332 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
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PTPRSQ13332 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRSQ13332 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRSQ13332 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRSQ13332 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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