Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SGCGQ13326 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCGQ13326 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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