Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME3Q13232 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME3Q13232 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME3Q13232 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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