Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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NR1H3Q13133 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR1H3Q13133 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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