Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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