Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms