Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms