Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms