Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIPAL4Q0D2K0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms