Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms