Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSRP1Q08945 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms