Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLEQ07864 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms