Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms