Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms