Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms